La facultad cuenta con 3 maestrías acreditadas de Excelencia por la Junta de Acreditación Nacional del MES: Psicología Educativa, Psicología Clínica, Psicología Laboral y de las Organizaciones. Dichos programas están dirigidos a desarrollar competencias y habilidades investigativas en las diferentes áreas de actuación de la Psicología.
Los requisitos específicos de matrícula de cada maestría se pueden obtener a través de los contactos de los coordinadores.